Köpekler Kurtlara Karşı, dileği dönüşüp bir kurda dönüşen Freddy Lupin'in hikayesini konu ediyor. Cesur kaniş Freddy Lupin, kurt adam sürüsüne liderlik etme potansiyeline sahip olsa da kimse onu ciddiye almaz. Ancak dileği beklenmedik bir şekilde gerçekleşince Freddy kurda dönüşür ve bu sırada yaramaz bir ay parçasını da dünyaya getirir. Ancak bu durum dünya ile ay arasında bir kaos yaratır. En iyi arkadaşı, zeki sokak köpeği Batty ve diğer köpek arkadaşlarıyla birlikte Freddy, kozmik dengeyi yeniden sağlamak için heyecan dolu bir maceraya atılır.